中国人民银行衢州市分行作为中国人民银行的派出机构，根据上级行授权，贯彻执行货币政策，维护本辖区的金融稳定，提供金融服务，并承办职责范围内的有关业务。分行内设19个科室，分别为办公室（党委办公室）、法律事务科（内审科）、货币信贷政策管理科、宏观审慎与金融市场管理科、金融稳定科、统计研究科、支付结算科（营业室）、科技科、货币金银科、国库科、征信管理科、反洗钱科、国际收支科、外汇管理科、区域金融科、会计财务科、人事科（党委组织部）、机关党委办公室（党委宣传部）、纪委办公室。